Procédé pour la détection de la méthylation de l’adénine et ses applications.
Aperçu de la technologie
La présente invention concerne un procédé pour diagnostiquer le phénomène de la méthylation de l’adénine dans le génome bactérien. Le procédé est basé sur un processus prédictif stochastique simple des chaines de markov caché (hmm). Le modèle proposé a été validé par des séquences de méthylation artificielles, car il a été comparé aux résultats de méthylation du génome complet de e. Coli séquencé par la méthode de séquençage en temps réel à molécule unique (smrt). Les résultats de validation du modèle dam-hmm ont démontré une sensibilité élevée (92%) et spécificité (94%) au méthylome de dma selon les résultats de la comparaison avec les séquences artificielles. Ainsi, nous rapportons également que les résultats de la simulation montrent une spécificité et une similarité élevées avec l'adn de smrt, comme décrit dans d'autres études expérimentales antérieures.